Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBE1Q9UJT0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms