Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms