Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms