Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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