Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms