Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms