Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SGF29Q96ES7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SGF29Q96ES7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SGF29Q96ES7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SGF29Q96ES7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms