Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms