Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHDC3Q96DC8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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