Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF4BQ92750 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms