Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms