Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms