Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRC17Q8N6Y2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LRRC17Q8N6Y2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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