Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms