Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPANXN3Q5MJ09 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPANXN3Q5MJ09 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms