Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms