Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms