Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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