Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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