Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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UBE3CQ15386 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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UBE3CQ15386 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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UBE3CQ15386 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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UBE3CQ15386 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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UBE3CQ15386 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3CQ15386 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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