Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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