Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms