Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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