Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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