Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TROQ12816 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TROQ12816 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TROQ12816 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TROQ12816 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TROQ12816 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TROQ12816 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TROQ12816 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TROQ12816 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TROQ12816 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
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