Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF5Q12774 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms