Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FMODQ06828 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms