Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP7AQ04656 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms