Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms