Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2FP61218 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms