Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTAP49354 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms