Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms