Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRT20P35900 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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KRT20P35900 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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KRT20P35900 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRT20P35900 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRT20P35900 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRT20P35900 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRT20P35900 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRT20P35900 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRT20P35900 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRT20P35900 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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