Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms