Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms