Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms