Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms