Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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