Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARAFP10398 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARAFP10398 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms