Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLI3P10071 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms