Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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