Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms