Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLDN11O75508 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLDN11O75508 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLDN11O75508 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLDN11O75508 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLDN11O75508 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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