Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms