Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNMO15061 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms