Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms