Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PHGR1C9JFL3 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms