Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4E171 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4E171 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4E171 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
B4E171 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
B4E171 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms