Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms