Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms